微生物データベースの開発

OVERVIEW概要

微生物の菌株情報やゲノム配列データを一元管理する統合データベースと、ブラウザ上から直接BLASTを実行・可視化できるWebアプリケーションを開発しました。コマンドライン操作に慣れていない研究者でも、直感的なUIを通じて目的の微生物データの検索から配列アライメント解析、結果のフィルタリング・ダウンロードまでをワンストップで行える解析基盤を提供しました。

RESULT成果

分散していた微生物情報が集約され、専門的なコマンド操作を必要とせずWeb上で迅速に高精度な配列解析を実行できる環境を確立しました。解析結果の確認がスムーズに行えるようになったことで、目的の菌株選定や新規遺伝子の探索にかかる作業負担を軽減し、研究開発におけるデータ活用と解析業務の効率化を技術面から支えるプラットフォームを構築しました。

UIも非常に扱いやすく設計されていて大変助かっています。

国立大学研究室 助教